virové částice (viriony), a nejsou ve smyslu slova izolace ani izolovány, ani biochemicky charakterizovány. V případě SARS-CoV-2 se celková RNA často extrahuje ze vzorků pacientů (např. z bronchoalveolární laváže (BAL) nebo z výtěrů z krku a nosu) a následně se sekvenuje. Neexistuje žádný důkaz toho, že fragmenty RNA použité k výpočtu sekvencí virového genomu jsou virového původu.